实验室位于宁波市著名的旅游度假区东钱湖湖畔。由中国科学院水生生物研究所、宁波东钱湖旅游度假区管委会、浙江天韵生态环境工程有限公司共同组建。实验室总投资1600万元，建筑面积2000多平方米。实验室实行一套班子两块牌子的管理模式，即中科院水生所淡水生态与生物技术国家重点实验室宁波实验室和浙江国科生态技术研究有限公司合署办公。
    实验室以中科院水生所长期积累的研究成果和研究能力为依托，淡水生态与生物技术国家重点实验室为平台，东钱湖等生态环境保护成功经验为范例，立足于宁波市，面向浙江及华东地区经济、社会发展需求，以湖泊、湿地等水生态修复与保育为主要发展方向，在水域生态环境、生物技术等领域，开展科学研究、技术服务、人才培养、科技创新等工作，并推进科技成果产业化。实验室将实行“开放、流动、联合、竞争”的运行机制，建立水环境、水生物相关技术领域研发和合作交流平台，创新科技合作模式，建设成为高效运行的、开放的、具有地方特色的水生态环境、生物技术知识创新和研发中心，为地方水环境治理、水生态保护、水生态文明建设及产业发展提供服务。